No filme, o mago Merlin e seus aprendizes, Balthazar Blake e Verônica Gorloisen, enfrentam a feiticeira Morgana Le Fay e seu aprendiz, Maxim Horvath, um ex-aprendiz de Merlin que aliou-se a Morgana após ser rejeitado por Verônica, que ama Blake.
Durante o confronto, Verônica absorve a alma de Morgana para dentro de seu corpo para salvar Blake, que as aprisiona ao lado de Horvath em uma dimensão compacta cuja chave é um artefato mágico conhecido como Grimhold.
Mortalmente ferido, Merlin recita um encanto que dá a Blake juventude eterna e o encarrega de encontrar o próximo Merliniano, seu sucessor. Para ajudá-lo, Blake recebe um anel mágico em forma de dragão que irá enrolar-se ao redor do dedo daquele com potencial para ser Blake procura.
Após anos procurando o próximo Merliniano e protegendo o Grimhold dos seguidores de Morgana, Blake abre uma loja de antiguidades em Nova York. Um dia, em 2000, um menino chamado Dave Stutter entra na loja e toca no anel de dragão, que enrola-se em seu dedo, revelando que ele pode ser o próximo Merliniano.
Porém, Dave acidentalmente liberta Horvath, que ataca Blake. O confronto acaba quando os dois são presos em uma urna mágica com uma trava de 10 anos. Dave não tem como provar o que aconteceu e ainda é encontrado com as calças molhadas devido a um vaso que quebrou em seu colo, o que leva todos a acreditarem que ele é um fracassado.
10 anos depois, em 2010, Dave, agora um estudante de Física da Universidade de Nova Iorque, reencontra uma amiga dos tempos de escola, a estudante de música Becky Barnes, por quem se apaixona. Paralelamente, a urna se abre e Horvath escapa primeiro. Ele rastreia Dave, a última pessoa a possuir o Grimhold, e tenta forçá-lo a entregar o artefato, que Dave revela ter jogado fora após a luta entre Horvath e Blake.
Horvath prepara-se para matar Dave, que é salvo por Blake, que também conseguiu escapar da urna. Blake conta a Dave que ele tem o potencial para tornar-se um grande feiticeiro, mas Dave quer apenas uma vida normal e concorda em ajudar Blake a encontrar o Grimhold para poder encerrar esse capítulo de sua vida.
Eles rastreiam o artefato até Chinatown, onde enfrentam o feiticeiro Sun Lok e conseguem recuperar o Grimhold. Dave decide que quer aprender mágica e aceita tornar-se o aprendiz de Blake.
Paralelamente, Horvath, que descobriu que Dave é o próximo Merliniano, recruta o mágico de Las Vegas Drake Stone para ajudá-lo e destruir Dave e recuperar o Grimhold para libertar Morgana. Após quase ser morto pela dupla, Dave descobre de Blake que, se Morgana for libertada, ela irá invocar os espíritos de feiticeiros mortos e usar os poderes deles para destruir o mundo. Dave é o único que pode impedí-la.
Horvath e Drake roubam o Grimhold e libertam a bruxa Abigail Williams, que rapta Becky a mando de Horvath, que, por sua vez, mata Drake após este deixar de ser útil. Horvath e Abigail libertam Morgana, que começa a invocar os mortes. Dave e Blake chegam par impedí-los e Blake enfrenta Horvath novamente, dessa vez, derrotando-o.
Dave salva Becky e usa seus poderes sem o anel de dragão, provando que ele é o próximo Merliniano. Enquanto isso, Blake absorve a alma de Morgana, libertando Verônica, mas Morgana consegue fugir e matá-lo. Dave, combinando seus poderes mágicos com seus conhecimentos científicos, consegue destruir Morgana para sempre e reviver Blake, que é reunido com Verônica, seu grande amor, assim como Dave, que finalmente reune-se com Becky.
Em uma cena após os créditos, o chapéu de Horvath é visto em uma mesa na loja de antiguidades de Blake. Uma mão aparece e o pega. As sombras da figura indicam ser o próprio Horvath, que não morreu.
